Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT4P19013 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT4P19013 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT4P19013 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT4P19013 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KRT4P19013 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT4P19013 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT4P19013 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT4P19013 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT4P19013 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT4P19013 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KRT4P19013 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT4P19013 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KRT4P19013 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT4P19013 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT4P19013 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT4P19013 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT4P19013 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT4P19013 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KRT4P19013 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KRT4P19013 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT4P19013 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT4P19013 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT4P19013 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT4P19013 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT4P19013 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KRT4P19013 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KRT4P19013 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KRT4P19013 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT4P19013 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT4P19013 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT4P19013 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT4P19013 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT4P19013 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRT4P19013 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT4P19013 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT4P19013 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT4P19013 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT4P19013 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRT4P19013 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT4P19013 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT4P19013 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT4P19013 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT4P19013 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT4P19013 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT4P19013 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRT4P19013 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT4P19013 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT4P19013 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRT4P19013 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT4P19013 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT4P19013 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT4P19013 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT4P19013 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT4P19013 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRT4P19013 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT4P19013 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT4P19013 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT4P19013 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT4P19013 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRT4P19013 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms