Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IL7RP16871 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IL7RP16871 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IL7RP16871 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IL7RP16871 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL7RP16871 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL7RP16871 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IL7RP16871 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL7RP16871 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IL7RP16871 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IL7RP16871 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL7RP16871 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL7RP16871 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IL7RP16871 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL7RP16871 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IL7RP16871 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IL7RP16871 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IL7RP16871 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IL7RP16871 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IL7RP16871 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IL7RP16871 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL7RP16871 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL7RP16871 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL7RP16871 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL7RP16871 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IL7RP16871 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IL7RP16871 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IL7RP16871 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL7RP16871 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IL7RP16871 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IL7RP16871 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL7RP16871 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL7RP16871 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL7RP16871 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IL7RP16871 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL7RP16871 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL7RP16871 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL7RP16871 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL7RP16871 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL7RP16871 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL7RP16871 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IL7RP16871 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IL7RP16871 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms