Protein–RNA interactions for Protein: P13796

LCP1, Plastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP1P13796 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LCP1P13796 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCP1P13796 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCP1P13796 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LCP1P13796 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCP1P13796 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCP1P13796 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LCP1P13796 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LCP1P13796 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCP1P13796 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCP1P13796 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCP1P13796 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LCP1P13796 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCP1P13796 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCP1P13796 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCP1P13796 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCP1P13796 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCP1P13796 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LCP1P13796 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LCP1P13796 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCP1P13796 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCP1P13796 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCP1P13796 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LCP1P13796 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCP1P13796 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LCP1P13796 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCP1P13796 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCP1P13796 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LCP1P13796 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCP1P13796 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCP1P13796 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCP1P13796 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LCP1P13796 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCP1P13796 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LCP1P13796 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCP1P13796 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCP1P13796 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LCP1P13796 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCP1P13796 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCP1P13796 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCP1P13796 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LCP1P13796 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCP1P13796 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LCP1P13796 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCP1P13796 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LCP1P13796 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCP1P13796 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCP1P13796 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LCP1P13796 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LCP1P13796 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCP1P13796 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCP1P13796 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCP1P13796 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCP1P13796 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LCP1P13796 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LCP1P13796 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCP1P13796 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCP1P13796 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LCP1P13796 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LCP1P13796 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCP1P13796 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCP1P13796 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCP1P13796 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LCP1P13796 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCP1P13796 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LCP1P13796 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCP1P13796 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCP1P13796 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCP1P13796 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCP1P13796 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCP1P13796 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LCP1P13796 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCP1P13796 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCP1P13796 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCP1P13796 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCP1P13796 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LCP1P13796 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LCP1P13796 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms