Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CEACAM1P13688 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CEACAM1P13688 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CEACAM1P13688 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms