Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP10827 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP10827 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP10827 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP10827 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP10827 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRAP10827 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP10827 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP10827 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRAP10827 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP10827 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP10827 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP10827 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP10827 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP10827 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRAP10827 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP10827 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRAP10827 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRAP10827 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP10827 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP10827 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP10827 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP10827 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP10827 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
THRAP10827 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP10827 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP10827 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP10827 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP10827 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP10827 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP10827 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP10827 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP10827 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP10827 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP10827 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP10827 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP10827 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP10827 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP10827 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP10827 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP10827 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP10827 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP10827 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP10827 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP10827 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP10827 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP10827 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP10827 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRAP10827 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THRAP10827 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
THRAP10827 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP10827 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP10827 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRAP10827 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP10827 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP10827 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP10827 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP10827 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP10827 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRAP10827 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP10827 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP10827 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP10827 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP10827 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP10827 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRAP10827 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP10827 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP10827 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP10827 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP10827 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP10827 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRAP10827 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRAP10827 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms