Protein–RNA interactions for Protein: P0CG01

GKN3P, Gastrokine-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN3PP0CG01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN3PP0CG01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GKN3PP0CG01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GKN3PP0CG01 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN3PP0CG01 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN3PP0CG01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN3PP0CG01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN3PP0CG01 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN3PP0CG01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GKN3PP0CG01 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GKN3PP0CG01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms