Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNRPB2P08579 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPB2P08579 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPB2P08579 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPB2P08579 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPB2P08579 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNRPB2P08579 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPB2P08579 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNRPB2P08579 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNRPB2P08579 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms