Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFLP07196 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFLP07196 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEFLP07196 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEFLP07196 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEFLP07196 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEFLP07196 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEFLP07196 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEFLP07196 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEFLP07196 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEFLP07196 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEFLP07196 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NEFLP07196 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NEFLP07196 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NEFLP07196 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NEFLP07196 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NEFLP07196 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEFLP07196 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEFLP07196 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEFLP07196 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEFLP07196 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEFLP07196 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEFLP07196 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEFLP07196 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEFLP07196 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEFLP07196 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEFLP07196 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEFLP07196 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NEFLP07196 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEFLP07196 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEFLP07196 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEFLP07196 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NEFLP07196 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
NEFLP07196 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEFLP07196 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEFLP07196 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEFLP07196 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEFLP07196 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEFLP07196 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEFLP07196 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEFLP07196 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEFLP07196 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEFLP07196 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEFLP07196 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEFLP07196 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEFLP07196 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEFLP07196 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEFLP07196 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEFLP07196 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEFLP07196 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEFLP07196 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEFLP07196 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEFLP07196 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEFLP07196 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NEFLP07196 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEFLP07196 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEFLP07196 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEFLP07196 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEFLP07196 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEFLP07196 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEFLP07196 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEFLP07196 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEFLP07196 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NEFLP07196 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms