Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TTRP02766 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TTRP02766 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTRP02766 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTRP02766 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTRP02766 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTRP02766 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TTRP02766 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TTRP02766 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTRP02766 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTRP02766 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TTRP02766 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTRP02766 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTRP02766 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTRP02766 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTRP02766 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTRP02766 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TTRP02766 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TTRP02766 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTRP02766 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TTRP02766 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTRP02766 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TTRP02766 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TTRP02766 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTRP02766 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTRP02766 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTRP02766 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTRP02766 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTRP02766 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TTRP02766 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TTRP02766 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTRP02766 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTRP02766 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTRP02766 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTRP02766 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TTRP02766 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TTRP02766 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTRP02766 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTRP02766 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTRP02766 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTRP02766 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TTRP02766 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TTRP02766 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTRP02766 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTRP02766 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTRP02766 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTRP02766 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTRP02766 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TTRP02766 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTRP02766 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTRP02766 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTRP02766 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTRP02766 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTRP02766 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TTRP02766 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TTRP02766 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTRP02766 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTRP02766 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TTRP02766 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTRP02766 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTRP02766 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTRP02766 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTRP02766 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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