Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFNA21P01568 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
IFNA21P01568 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IFNA21P01568 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms