Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL3O95236 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL3O95236 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOL3O95236 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL3O95236 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL3O95236 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL3O95236 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL3O95236 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL3O95236 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOL3O95236 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APOL3O95236 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL3O95236 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
APOL3O95236 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
APOL3O95236 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL3O95236 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL3O95236 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
APOL3O95236 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
APOL3O95236 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
APOL3O95236 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOL3O95236 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOL3O95236 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOL3O95236 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOL3O95236 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
APOL3O95236 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOL3O95236 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOL3O95236 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOL3O95236 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOL3O95236 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOL3O95236 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
APOL3O95236 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
APOL3O95236 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
APOL3O95236 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
APOL3O95236 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
APOL3O95236 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL3O95236 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
APOL3O95236 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms