Protein–RNA interactions for Protein: O76031

CLPX, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPXO76031 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPXO76031 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPXO76031 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPXO76031 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPXO76031 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPXO76031 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPXO76031 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPXO76031 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPXO76031 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLPXO76031 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPXO76031 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPXO76031 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPXO76031 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPXO76031 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPXO76031 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPXO76031 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPXO76031 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPXO76031 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPXO76031 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPXO76031 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLPXO76031 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPXO76031 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLPXO76031 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPXO76031 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPXO76031 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPXO76031 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPXO76031 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPXO76031 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPXO76031 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPXO76031 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPXO76031 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPXO76031 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPXO76031 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPXO76031 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPXO76031 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPXO76031 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPXO76031 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPXO76031 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPXO76031 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPXO76031 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPXO76031 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPXO76031 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPXO76031 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPXO76031 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPXO76031 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPXO76031 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPXO76031 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPXO76031 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPXO76031 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPXO76031 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPXO76031 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPXO76031 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPXO76031 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPXO76031 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPXO76031 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPXO76031 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPXO76031 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPXO76031 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPXO76031 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms