Protein–RNA interactions for Protein: O60245

PCDH7, Protocadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH7O60245 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDH7O60245 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDH7O60245 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDH7O60245 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms