Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LDB2O43679 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDB2O43679 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDB2O43679 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDB2O43679 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LDB2O43679 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
LDB2O43679 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LDB2O43679 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LDB2O43679 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LDB2O43679 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB2O43679 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB2O43679 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB2O43679 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB2O43679 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LDB2O43679 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LDB2O43679 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LDB2O43679 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDB2O43679 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDB2O43679 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDB2O43679 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LDB2O43679 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB2O43679 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB2O43679 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LDB2O43679 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB2O43679 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB2O43679 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB2O43679 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB2O43679 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB2O43679 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB2O43679 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LDB2O43679 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDB2O43679 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LDB2O43679 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LDB2O43679 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDB2O43679 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LDB2O43679 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB2O43679 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB2O43679 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB2O43679 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB2O43679 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB2O43679 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB2O43679 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LDB2O43679 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LDB2O43679 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LDB2O43679 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDB2O43679 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDB2O43679 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LDB2O43679 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LDB2O43679 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LDB2O43679 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB2O43679 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB2O43679 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB2O43679 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB2O43679 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LDB2O43679 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LDB2O43679 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LDB2O43679 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms