Protein–RNA interactions for Protein: O43474

KLF4, Krueppel-like factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF4O43474 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF4O43474 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF4O43474 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF4O43474 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF4O43474 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF4O43474 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF4O43474 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF4O43474 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF4O43474 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF4O43474 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF4O43474 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF4O43474 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF4O43474 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF4O43474 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF4O43474 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF4O43474 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF4O43474 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF4O43474 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF4O43474 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF4O43474 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF4O43474 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF4O43474 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF4O43474 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF4O43474 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF4O43474 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF4O43474 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF4O43474 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF4O43474 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF4O43474 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF4O43474 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF4O43474 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF4O43474 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLF4O43474 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLF4O43474 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF4O43474 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF4O43474 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF4O43474 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF4O43474 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF4O43474 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF4O43474 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF4O43474 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF4O43474 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF4O43474 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF4O43474 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF4O43474 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF4O43474 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF4O43474 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF4O43474 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF4O43474 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF4O43474 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF4O43474 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF4O43474 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF4O43474 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF4O43474 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF4O43474 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF4O43474 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF4O43474 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF4O43474 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF4O43474 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms