Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBDO15205 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBDO15205 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBDO15205 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBDO15205 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBDO15205 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBDO15205 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBDO15205 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBDO15205 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBDO15205 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBDO15205 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBDO15205 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBDO15205 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBDO15205 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBDO15205 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBDO15205 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBDO15205 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBDO15205 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBDO15205 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBDO15205 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBDO15205 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBDO15205 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBDO15205 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBDO15205 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBDO15205 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBDO15205 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBDO15205 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBDO15205 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBDO15205 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBDO15205 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBDO15205 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBDO15205 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBDO15205 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBDO15205 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBDO15205 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBDO15205 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBDO15205 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBDO15205 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBDO15205 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBDO15205 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBDO15205 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBDO15205 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBDO15205 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBDO15205 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBDO15205 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBDO15205 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBDO15205 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBDO15205 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBDO15205 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBDO15205 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBDO15205 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBDO15205 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBDO15205 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBDO15205 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBDO15205 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBDO15205 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBDO15205 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBDO15205 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBDO15205 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBDO15205 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBDO15205 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBDO15205 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBDO15205 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBDO15205 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBDO15205 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBDO15205 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBDO15205 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBDO15205 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBDO15205 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBDO15205 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBDO15205 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBDO15205 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms