Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RFXANKO14593 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFXANKO14593 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFXANKO14593 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFXANKO14593 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFXANKO14593 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms