Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPEO14579 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COPEO14579 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COPEO14579 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPEO14579 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
COPEO14579 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPEO14579 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPEO14579 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COPEO14579 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COPEO14579 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPEO14579 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPEO14579 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPEO14579 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPEO14579 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COPEO14579 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COPEO14579 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPEO14579 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPEO14579 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPEO14579 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPEO14579 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPEO14579 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COPEO14579 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPEO14579 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPEO14579 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPEO14579 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COPEO14579 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COPEO14579 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPEO14579 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPEO14579 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPEO14579 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPEO14579 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COPEO14579 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPEO14579 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COPEO14579 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPEO14579 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COPEO14579 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPEO14579 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPEO14579 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPEO14579 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COPEO14579 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPEO14579 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPEO14579 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPEO14579 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPEO14579 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COPEO14579 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPEO14579 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPEO14579 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPEO14579 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPEO14579 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COPEO14579 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPEO14579 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COPEO14579 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPEO14579 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPEO14579 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COPEO14579 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPEO14579 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COPEO14579 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPEO14579 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPEO14579 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COPEO14579 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPEO14579 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COPEO14579 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
COPEO14579 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COPEO14579 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPEO14579 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COPEO14579 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COPEO14579 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms