Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 YIPF2-202ENST00000585858 656 ntTSL 317.86■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 YIPF2-207ENST00000588962 788 ntTSL 217.86■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 YIPF2-205ENST00000587943 796 ntTSL 517.76■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 YIPF2-211ENST00000592505 530 ntTSL 316.61■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.474e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.334e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 SLC44A1-201ENST00000374720 10511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.564e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 SLC44A1-205ENST00000470972 10433 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.584e-11■■■■■ 55.6
DDX3XO00571 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.894e-8■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.164e-8■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 ACOT7-205ENST00000377860 1472 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 ACOT7-206ENST00000418124 1564 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.314e-8■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 SQLE-205ENST00000521232 711 ntTSL 317.39■□□□□ 0.374e-43■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.643e-10■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 222.23■■□□□ 1.153e-10■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 13e-10■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.823e-10■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 519.27■□□□□ 0.683e-10■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 518.7■□□□□ 0.583e-10■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.433e-10■■■■■ 55.5
DDX3XO00571 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ZDHHC12-204ENST00000452105 644 ntTSL 219.51■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ZDHHC12-205ENST00000467312 2536 ntTSL 219.12■□□□□ 0.656e-8■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ZDHHC12-203ENST00000406904 646 ntTSL 216.78■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.176e-8■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ARF4-208ENST00000495354 495 ntTSL 312.03□□□□□ -0.489e-26■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ARF4-209ENST00000496292 1467 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.29e-26■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ARF4-204ENST00000486310 1601 ntTSL 37.49□□□□□ -1.219e-26■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.589e-26■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 PDK2-206ENST00000505897 865 ntTSL 228.86■■■□□ 2.216e-12■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 PDK2-204ENST00000503614 947 ntTSL 318.33■□□□□ 0.526e-12■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.356e-12■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 PDK2-210ENST00000508960 553 ntTSL 215.38■□□□□ 0.056e-12■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.016e-12■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 PDK2-209ENST00000508030 578 ntTSL 413.15□□□□□ -0.36e-12■■■■■ 55.4
DDX3XO00571 GPX4-205ENST00000587932 274 ntTSL 229.05■■■□□ 2.247e-28■■■■■ 55.3
DDX3XO00571 ALDOA-224ENST00000568435 935 ntTSL 1 (best)17.51■□□□□ 0.397e-27■■■■■ 55.2
DDX3XO00571 ABHD14A-ACY1-229ENST00000637978 1758 ntAPPRIS P5 TSL 517.7■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 55.2
DDX3XO00571 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.663e-8■■■■■ 55.1
DDX3XO00571 NMRAL1-216ENST00000575995 413 ntTSL 314.54□□□□□ -0.082e-9■■■■■ 55.1
DDX3XO00571 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.541e-8■■■■■ 55
DDX3XO00571 STX3-205ENST00000530498 690 ntTSL 216.67■□□□□ 0.261e-8■■■■■ 55
DDX3XO00571 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 54.9
DDX3XO00571 MRPL15-202ENST00000519831 601 ntTSL 29.98□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 54.9
DDX3XO00571 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 29.43□□□□□ -0.95e-28■■■■■ 54.8
DDX3XO00571 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.194e-43■■■■■ 54.8
DDX3XO00571 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.534e-43■■■■■ 54.8
DDX3XO00571 YIPF2-206ENST00000588347 753 ntTSL 222.34■■□□□ 1.173e-11■■■■■ 54.7
DDX3XO00571 APH1A-209ENST00000493092 585 ntTSL 312.96□□□□□ -0.332e-22■■■■■ 54.7
DDX3XO00571 PRNP-204ENST00000457586 855 ntTSL 1 (best)24.02■■□□□ 1.447e-13■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.353e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-205ENST00000524547 703 ntTSL 321.08■□□□□ 0.973e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-216ENST00000534240 566 ntTSL 420.74■□□□□ 0.913e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-217ENST00000534433 1032 ntTSL 220.24■□□□□ 0.833e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-203ENST00000524426 1189 ntTSL 220.21■□□□□ 0.833e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-207ENST00000525961 509 ntTSL 419.39■□□□□ 0.693e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-209ENST00000527082 1262 ntTSL 1 (best)19.39■□□□□ 0.693e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.562e-23■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 TBC1D9B-216ENST00000522224 532 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-23■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-23■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-23■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.282e-23■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-213ENST00000530533 1437 ntTSL 216.65■□□□□ 0.263e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-208ENST00000526026 1336 ntTSL 216.49■□□□□ 0.233e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-215ENST00000533387 3197 ntTSL 216.36■□□□□ 0.213e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 DHX37-203ENST00000539298 4550 ntTSL 1 (best)14.29□□□□□ -0.123e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.163e-12■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.162e-23■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 SEMA3G-202ENST00000465657 848 ntTSL 316.57■□□□□ 0.246e-11■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.166e-11■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 SEMA3G-203ENST00000475739 616 ntTSL 315.04■□□□□ -06e-11■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 PTPRA-208ENST00000455631 1107 ntTSL 522.67■■□□□ 1.226e-26■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 PTPRA-207ENST00000431048 707 ntTSL 521.65■■□□□ 1.066e-26■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.526e-26■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.096e-26■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 PTPRA-204ENST00000380393 3636 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.826e-26■■■■■ 54.6
DDX3XO00571 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.61□□□□□ -0.073e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.588e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-204ENST00000471410 1210 ntTSL 212.86□□□□□ -0.358e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-205ENST00000475216 1224 ntTSL 212.04□□□□□ -0.488e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-201ENST00000286824 1270 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.758e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-10■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-208ENST00000494037 575 ntTSL 48.46□□□□□ -1.068e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-203ENST00000419600 1683 ntTSL 27.11□□□□□ -1.278e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-206ENST00000480976 553 ntTSL 46.12□□□□□ -1.438e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TSPAN7-207ENST00000488893 736 ntTSL 55.07□□□□□ -1.68e-9■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.134e-34■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.121e-17■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 MPHOSPH10-202ENST00000468427 483 ntTSL 414.04□□□□□ -0.164e-34■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.015e-8■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 SLC22A5-204ENST00000437841 850 ntTSL 514.8□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TRIQK-210ENST00000520384 556 ntTSL 55.68□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 TRIQK-217ENST00000523060 550 ntTSL 25.53□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-13■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 54.5
DDX3XO00571 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 54.5
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