Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC7O00311 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC7O00311 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDC7O00311 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDC7O00311 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC7O00311 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC7O00311 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC7O00311 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC7O00311 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC7O00311 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDC7O00311 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC7O00311 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC7O00311 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC7O00311 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC7O00311 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC7O00311 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC7O00311 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDC7O00311 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC7O00311 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC7O00311 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC7O00311 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC7O00311 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDC7O00311 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC7O00311 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDC7O00311 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC7O00311 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC7O00311 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC7O00311 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC7O00311 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC7O00311 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDC7O00311 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC7O00311 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC7O00311 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC7O00311 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC7O00311 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC7O00311 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDC7O00311 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC7O00311 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC7O00311 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDC7O00311 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDC7O00311 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC7O00311 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC7O00311 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC7O00311 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC7O00311 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC7O00311 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDC7O00311 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC7O00311 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC7O00311 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC7O00311 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC7O00311 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC7O00311 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDC7O00311 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC7O00311 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC7O00311 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDC7O00311 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDC7O00311 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC7O00311 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC7O00311 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDC7O00311 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC7O00311 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC7O00311 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC7O00311 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC7O00311 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDC7O00311 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC7O00311 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC7O00311 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDC7O00311 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDC7O00311 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms