Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
RGPD3A6NKT7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RGPD3A6NKT7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RGPD3A6NKT7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RGPD3A6NKT7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms