Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDR42E2A6NKP2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDR42E2A6NKP2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SDR42E2A6NKP2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SDR42E2A6NKP2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms