Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC13A5PLN9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC13A5PLN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAPPC13A5PLN9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC13A5PLN9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms