Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
XIRP2A4UGR9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
XIRP2A4UGR9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
XIRP2A4UGR9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
XIRP2A4UGR9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms