Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMIM30A4D0T7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMIM30A4D0T7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SMIM30A4D0T7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms