Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LINC00312Q9Y6C7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
LINC00312Q9Y6C7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms