Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SNX10Q9Y5X0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX10Q9Y5X0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms