Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATG4BQ9Y4P1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATG4BQ9Y4P1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms