Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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HCN4Q9Y3Q4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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HCN4Q9Y3Q4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HCN4Q9Y3Q4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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HCN4Q9Y3Q4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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HCN4Q9Y3Q4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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HCN4Q9Y3Q4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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HCN4Q9Y3Q4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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HCN4Q9Y3Q4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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HCN4Q9Y3Q4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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HCN4Q9Y3Q4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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HCN4Q9Y3Q4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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HCN4Q9Y3Q4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HCN4Q9Y3Q4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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