Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP11Q9Y3A2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms