Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHKBQ9Y259 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms