Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMG5Q9UPR3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms