Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED23Q9ULK4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms