Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSKSQ9UJT2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms