Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCN11AQ9UI33 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN11AQ9UI33 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms