Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CLN8Q9UBY8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CLN8Q9UBY8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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