Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAM8A1Q9UBU6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms