Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
COPG2Q9UBF2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
COPG2Q9UBF2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms