Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCHIP1Q9P0W5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms