Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RDH8Q9NYR8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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