Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NLE1Q9NVX2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms