Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARVAQ9NVD7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARVAQ9NVD7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms