Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC4BQ9NT99 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC4BQ9NT99 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms