Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATG3Q9NT62 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATG3Q9NT62 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms