Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPMQ9NSP4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms