Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPS45Q9NRW7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms