Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPRSS4Q9NRS4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms