Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CASS4Q9NQ75 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms