Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms