Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3GQ9HC16 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms